Nel 1566Ottavio Farnese, signore di Castellammare, in seguito alle proteste dei cittadini, decise di donare alla città un luogo adeguato per la sede della Corte del Governatore: la scelta cadde su un caseggiato[30] a un piano situato tra il Duomo e via Coppola, nell’attuale Piazza Giovanni XXIII. Nel 1820 vi venne trasferita la sede dell’Amministrazione comunale e nel 1871, su progetto dell’architetto Luigi d’Amora, il palazzo fu ingrandito e abbellito. Il secondo piano venne costruito soltanto agli inizi del Novecento, con l’aggiunta di una piccola torre laterale. L’amministrazione comunale vi restò fino al 1964, quando fu deciso il passaggio nell’ex sede della Banca d’Italia e Palazzo Farnese venne abbandonato. Dopo alcuni anni la struttura tornò ad essere a disposizione del comune e, finiti i lavori di ristrutturazione, venne nuovamente adibito a Municipio: palazzo Farnese svolge ancora oggi tale funzione. Da alcuni anni si è creato al suo interno anche un piccolo Museo Civico.